蛋白质组学

蛋白质组学听课笔记汇总贴

前言

话说,自从去年年底,小编参加了克里克学院组织的蛋白质组学网络大课堂以来,感觉已经作为酱油成员,登上了蛋白质组学这艘航母,内心是有点小窃喜的~

更让小编开心的是,先后分享出来的十三篇听课笔记,到目前为止一共被阅读了上万次,还有很多小伙伴给小编留言,要么赞扬,要么鼓励,要么一起探讨里面的知识点,让小编觉得码字的所有辛苦都是值得的!

这些听课笔记,是网络课堂的前四堂课的核心知识点,正好从综述、实验、仪器及数据分析四个层面,比较完整地介绍了当前蛋白质组学的基本轮廓和框架。

为了让大伙儿点贴更方便,小编把这十几篇听课笔记做了一个汇总,大伙儿如果想留着慢慢看,重点收藏这个帖子就可以啦~

课程总结

第一课

1

>> 听课笔记之蛋白质组学研究方法概述(上)

知识点:

--基于质谱的蛋白质组学:质谱技术的前世今生

--蛋白定性检测:背景介绍、二级质谱、鉴定碎片离子

2

>> 听课笔记之蛋白质组学研究方法概述(下)

知识点:

--蛋白定性检测(续):搜库工具、搜库流程、鉴定结果评估

--蛋白定量检测:基于MS1的定量、基于MS2的定量

--靶向蛋白质组学:SRM/MRM、DIA

第二课

1

>> 听课笔记之蛋白质组学样品前处理(一)

知识点:

--样品前处理的目的

--样品的收集与保存:组织样品、细胞样品、血清样品

--样品的破碎:机械破碎、物理破碎、化学处理

2

>> 听课笔记之蛋白质组学样品前处理(二)

知识点:

--动物组织样品的处理步骤

--动物细胞样品的处理步骤

--石蜡包埋样品的处理步骤

--植物组织样品的处理步骤

--细菌样品的处理步骤

--体液样品的处理步骤

--亚细胞器蛋白的提取方法

3

>> 听课笔记之蛋白质组学样品前处理(三)

知识点:

--蛋白提取的质量控制

--脱盐的处理方法

--还原烷基化及酶解的步骤

--蛋白质及肽段的预分级

4

>> 听课笔记之蛋白质组学样品前处理(四)

知识点:

--自动化样品前处理的新方法一:StageTips

--自动化样品前处理的新方法二:PCT压力循环系统

第三课

1

>> 听课笔记之蛋白质谱的原理及使用(一)

知识点:

--什么是质谱仪

--质谱仪的分类介绍:磁质谱仪、飞行时间质谱仪、四级杆质谱仪、离子阱质谱仪、FTICR和Orbitrap

2

>> 听课笔记之蛋白质谱的原理及使用(二)

知识点:

--质谱仪性能参数:检测限、线性范围、分辨率和质量准确度

--串联质谱类型及工作原理

--质谱辅助系统

3

>> 听课笔记之蛋白质谱的原理及使用(三)

知识点:

--液相色谱仪及组成

--液质联用技术

4

>> 听课笔记之蛋白质谱的原理及使用(四)

知识点:

--质谱仪的使用与维护

--纳升液相系统的使用与维护

--液质联用系统的检查和保养

--质谱运行状态的评估

第四课

1

>> 听课笔记之蛋白质组学数据分析基础(一)

知识点:

--质谱数据格式

--结果报告的质控

--DDA模式的工作原理

2

>> 听课笔记之蛋白质组学数据分析基础(二)

知识点:

--同位素对质谱分析的影响

--原始谱图的处理

--什么是b-y离子

3

>> 听课笔记之蛋白质组学数据分析基础(三)

知识点:

--DIA数据非依赖性采集

--搜库原理及技巧

--蛋白质组学相关的数据库及使用方法

致谢






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