蛋白质组学

蛋白质组学怎样研究?

相对于基因组而言,由于蛋白质组的结构复杂、不同蛋白的数量差别大以及样品处理较为复杂等原因,使得蛋白质组的发展滞后于基因组学研究。随着质谱技术的进步,质谱的灵敏度,分辨率以及扫描速度等都得到了很大的提升,这极大地推动了蛋白质组学的发展。

质谱仪的快速发展

基于质谱的蛋白质组学研究的实验流程如下[1],主要包括样品的前处理、质谱检测和数据分析等。在样品分析前处理的过程中,为了提高质谱鉴定的深度和覆盖率,一般可采用高效液相色谱(HPLC)或者离子交换色谱(Ionexchange)对肽段进行分级。质谱检测中常用到的离子化方法有电喷雾离子化(ESI)和基质辅助激光解吸离子化(MALDI),目前市场上常用的质谱分析器主要包括四级杆(Quadrupole)、离子阱(Ion trap)、轨道阱(Orbitrap)以及飞行时间(Time offlight)和傅里叶变换离子回旋共振(FTICR)。在后期的数据分析过程中,需要用到Mascot、Sequest或者MaxQuant等搜库引擎或搜库软件。

蛋白质组学研究的实验流程





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