蛋白质组学

非标定量蛋白质组学定量分析流程

Agonyr

Label-free指的是非标定量蛋白质组学技术。有10个组织样品,分别提取蛋白质并酶解成肽段。然后每一个肽段样品进行LC-MS分析,这样就得到10个MS数据;对于1条肽段,其在10个样品中的丰度(量)与其在MS1中的峰面积或信号强度成正比;理论上,对于10个样品中的同一条肽段,其在LC上的保留时间(retention time,RT)是一致的,因此,可以通过对比MS图谱,实现对蛋白质在不同样本中的相对表达水平的定量分析。

Label-free技术优势:

1、与SILAC, iTRAQ/TMT技术相比,样品无需任何标记,能最终程度地保留样品的“真实性”;

2、样品处理步骤简单,蛋白质只需酶解即可进行LC-MS分析;

3、能很大程度的节省样本制备费用。

但是只能单独对单个样本进行分析,分析通量降低,需要多次重复实验,定量精准度相对于iTRAQ和SILAC来说要差一些。

利用估计的蛋白定量信息进行后续分析步骤与常规定量蛋白质组数据分析相同。

 

 







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