蛋白质组学

TMT蛋白质组定量技术

TMT™(Tandem Mass Tag™)技术是由美国Thermo Scientific公司研发的一种多肽体外标记技术。该技术采用10种同位素的标签,通过特异性标记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团,而后进行串联质谱分析,可同时比较10组不同样品中蛋白质的相对含量。

TMT技术是常用的差异蛋白质组学技术,在疾病标记物筛选、药物作用靶点、动植物抗病/抗胁迫机制、动植物发育分化机理等领域都有广泛应用。

技术优势

灵敏度高:低丰度蛋白也能检测出
适用范围广:几乎可对任何物种的各类蛋白质进行分离鉴定
高通量:能同时对10组样本中包含的蛋白进行鉴定及表达差异分析
高效:液相色谱与串联质谱连用,自动化操作,分析速度快,分离效果好

研究背景

全球温度升高会对微生物群落造成影响,进而直接影响全球生态系统。科学家们在温度对微生物群落的群落结构和特定的代谢过程做了许多研究,而较少使用组学手段对整个群落的反应做出全面的评估。

研究内容

本文首次将TMT标记定量蛋白质组学技术应用在微生物群落研究上,精确地和可重复地在40℃、43℃和46℃三个温度条件下定量到上千个微生物蛋白质。作者发现,温度升高会引起单个微生物和整个群落的氨基酸代谢相关蛋白质上调,并抑制两类螺菌属微生物的固碳蛋白表达,然而在高温下第三类螺菌属微生物固碳蛋白则显著上调。

生物群落蛋白丰度变化分析

研究结果

定量蛋白质组学技术可以用于群落微生物研究,能鉴定到与代谢、生长、信号与压力反应等过程相关的上千个差异表达蛋白,并能在生态群落中对单个微生物组实现定量蛋白质组学研究。




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