蛋白质组学

蛋白表达和基因表达结果相反如何解释

我的实验中,Western blot显示蛋白水平随时间延长表达增加,但是RT-PCR结果却显示随时间表达减少,如何解释?

那看一下是不是蛋白降解减少?

有可能蛋白质的稳定性增加或者翻译效率增加,增加幅度大于mRNA降低所带来的蛋白理论水平降低的幅度

非常感谢给予支持,请问有没有相应的文献给楼上的解释支持呢?比如也有蛋白和基因结果不一致,使用以上解释的?

你取得时间点不合适,比如lps刺激macrophage表达iNOS蛋白,在前24小时之内,蛋白的表达量是呈上升趋势的,第16-18小时之间达到高峰,而iNOS mRNA的量在16-18小时之前是成增多趋势的,但是在18小时之后就呈现出递减趋势,当蛋白表达到一定水平时,细胞就会自己调节这些蛋白的产生通过各种方式,其中分解信使rna就是其中的一种方式。
建议楼主做一下24小时time course,来确定时间点的选取。

关于文献你查一下lps刺激macrophage细胞方面的文献,会对你有帮助

非常感谢各位的指点。我做的时间点是1天、3天、7天、14天、28天,蛋白水平随时间延长表达升高,但是基因水平表达随时间延长减少,而且3次实验结果趋势一致,我下一步如何做?

我最近做血清细胞因子对早产的影响的课题。标本血清,检测基因和蛋白水平水平,但是基因水平的检测遇到问题:提取RNA因标本放置时间过长,担心降解,故不予选择RT-PCR,但是普通PCR能说明什么问题呢???有必要提取DNA做普通PCR吗??谢谢各位帮助,急等回复,谢谢。

我也碰到类似问题,与空白对照组相比,给某种药物作用后,RT-PCR表达结果上调,但蛋白浓度却下调,应该如何解释啊?

一般基因水平的上调应该会早于蛋白水平的上调,你这个做基因的时间点是否可以考虑再提前一下,就是做个例如12h,24h,48h,72h看看。我觉得蛋白水平有上调,基因表达应该也有个上调的趋势,但是时间点可以不一致,但应该是基因早于蛋白。

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