蛋白质组学

若干常用蛋白质结构与位点分析网站

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几个常用蛋白质分析网站,分享一下!

1.从氨基酸组成辨识蛋白质

ExPASy:http://www.expasy.ch/tools/

PROSEARCH:http://www.embl-heidelberg.de/prs.html

2.预测蛋白质的物理性质:等电点、分子 量、酶切特性、疏水性、电荷分布等

ExPASy:http://www.expasy.ch/tools/

FASTA:ftp://ftp.virginia.edu/pub/fasta/

SAPS:http://www.isrec.isb-sib.ch/software/SAPS_form.html

3.跨膜区预测:http://www.isrec.isb-sib.ch/software/tmpred_from.html

4.蛋白质二级结构预测

nnPredict:http://www.cmpharm.ucsf.edu/~nomi/nnpredict.html

PredictProtein:http://cubic.bioc.columbia.edu/predictprotein/

PredictProtein的国内镜像:http://www.cbi.pku.edu.cn/predictprotein/

SOPMA:http://pbil.ibcp.fr/

5.二级结构预测:www.cmpharm.ucsf.edu/~nomi/nnpredict-instrucs.html

6.卷曲螺旋预测

COILS:http://www.ch.embnet.org/software/COILS_form.html

7.跨膜区段和在膜上的取向预测

TMpred:http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html

8.信号肽的剪切位点

SignalP:http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/

9.蛋白质的三维结构

SWISS-MODEL:http://www.expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html

CPHmodels:http://www.cbs.dtu.dk/services/CPHmodels/

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