蛋白质组学

转录因子研究——为论文加“分”

什么是转录因子?

l 转录因子(Transcription factor,TF)是一类能与特异性DNA序列结合并调节基因转录的调控蛋白。

l 转录因子通常是细胞内信号通路的核心蛋白,是将外界刺激转化为基因表达变化的关键调控者。

为什么要研究转录因子?

l 人体的35000多个基因在不同的组织、不同的时间具有表达差异性,转录因子的调控起到重要的作用。

l 2012年的诺贝尔生理学或医学奖得主山中伸弥,在小鼠成纤维细胞中表达Oct3/4、Sox2、c-Myc以及Klf4四种转录因子,将成纤维细胞逆转形成多能干细胞(iPS)。

l 转录因子与多种人类重大疾病相关,比如p53、myc、ER、Id与癌症相关;MEF2、HIF1与心脏疾病相关;NFκB与炎症相关;PPAR与肥胖相关等等。

怎样用转录因子研究为论文加“分”?

加“分”Step1

l 信号通路以及疾病相关的研究比较容易找到转录因子研究的突破口,已有在研项目的研究人员根据自身的研究背景,找准转录因子研究突破口。

l 对于还没有具体研究思路的科研人员来说,转录因子研究相对来说容易出结果、容易发文章,也容易进行深入地探索。

加“分”Step 2

l 转录因子种类繁多,研究比较多同时也是比较关键的转录因子大约有100种。

l 可以使用基因芯片,可以同时做很多目标蛋白的表达,但是相对来说面比较广,不会专门针对转录因子,后期数据分析以及后续目标选择方面比较困难。

l 推荐一种专门做转录因子的小高通量方法——“多重转录因子微孔板阵列检测试剂”。这个试剂专门做转录因子的,以标准96孔板微为载体,可以同时检测48/96种转录因子表达情况,操作过程跟ELISA实验差不多,结果数值化呈现,判读更直观、分析更简单。用这个做就更有针对性一点,只做常见的转录因子,后续的实验安排也更有针对性。

加“分”Step3

l 高通量筛查后,通常要对表达差异的转录因子进行验证。

l 验证方法很多,包括转录因子滤板法、EMSA、ELISA以及荧光素酶报告载体等。

l 特别推荐一种适用于大量样本检测的“转录因子滤板法检测试剂”,一次实验可以检测96个样本中的转录因子表达,也可以根据需求灵活调整样本数量。

加“分”Step4

l 到Step 3,就可以出一篇文章了,想发表高“分”文章还需要更多深入研究。

l 比如,向上游寻找转录因子差异表达的信号传导途径,或者向下游探索转录因子靶基因表达变化的影响。

l 还可以通过增大样本量、样本种类来提高文章水平。

(0)

热评文章

发表评论