蛋白质组学

组织内蛋白的糖基化位点检测新方法

N-连接的糖基化是一种具有重要生物学意义的翻译后修饰过程,但是现在已经发现的糖基化蛋白并不多。作者在这里采取了一种“滤纸收集样品(filter aided sample preparation,FASP)”的方法,籍此糖基化多肽可以富集于载有凝集素的滤纸上,然后用高精确度的质谱技术从小鼠的四种组织和血浆的2352种蛋白质上发现6367个糖基化位点。其中,涵盖了Swiss-port服务器中已经试验验证的830个糖基化位点中的74%,而另外5753个糖基化位点则是第一次被发现。 这些位点都带有” N-!P-[S|T]-!P (!P 不是脯氨酸)“这样的特征,也有些少见的 N-X-C基序或非保守序列。综合FASP及亚细胞糖基化位点定位分析揭示,这些糖基化位点一般都朝向胞外区或朝向ER腔、高尔基体、溶酶体或者过氧化物酶体。那些与发育、器官特定功能或者疾病相关的蛋白上有过多的糖基化修饰位点。

该研究的发现,是蛋白质组学中的一个重大进展,因为研究结果有助于人们理解人体内的生理生化过程。此外,对于了解疾病发生机制也有重要作用。科学家们一直在寻找细胞的蛋白质上哪些位点的修饰与疾病发生相关,例如哪些蛋白的糖基化与Alzheimer病相关,因此前的研究已经发现Alzheimer的发展过程中,N-糖基化是个很重要的因素,科学家们怀疑蛋白质的糖基化甚至与Alzheimer的转归相关。因此,本研究的结果,将深化对这些疾病发病机理的认识和探索。

【文章来源】D. Zielinska, F. Gnad, J. Wisniewski, M. Mann. Precision Mapping of an In Vivo N-Glycoproteome Reveals Rigid Topological and Sequence Constraints.Cell, May 28, 2010.

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