蛋白质组学

Label-free定量蛋白质组

Label-free定量不需要对比较样本做特定标记处理,只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化,通常用于分析大规模蛋白鉴定和定量时所产生的质谱数据。Label-free技术又可分为基于谱图数(Spectra
Count,简称SC)和基于肽段母离子强度(或色谱离子流的峰面积即XIC)两种方法,后者更准确,使用更广泛。Label-free技术对液相色谱串联质谱的稳定性和重复性要求较高,但无需昂贵的同位素标签做标记。
可提供Label-free定量蛋白质组技术服务,利用Label-free技术,也有不少高质量的文献发表。

 

一、服务特色

技术特点
1、无需标记,操作简单;
2、不受比较样品数限制;
3、对实验操作稳定性、重复性要求高,要求至少做三次技术重复或生物重复;
4、准确性较标记定量差。

适用范围
适合大样本量的定量比较
对无法用标记定量实现的实验设计,易用label-free技术
要求物种具有蛋白质参考数据库、EST序列(转录组)或基因组注释信息

 

二、服务说明

服务流程
接受订单及样品——蛋白酶解——HPLC分组分——LC-MS/MS——数据解析——结果交付

客户提供
需鉴定的样品;
样品信息单,需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息。

最终交付
实验报告一份,含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果(生物信息学分析)。
生物信息学分析内容包括:
Label-free定量:包括定量信息统计、蛋白质定量结果及肽段定量统计;
功能注释:包括GO注释、COG注释和Pathway代谢通路注释;
差异蛋白的富集分析:包括差异蛋白的GO富集分析和差异蛋白的Pathway富集分析
三、服务周期及报价

服务周期
自送样起45个工作日。

 

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