表观基因组学

DNA 羟甲基化测序(hMeDIP-seq)

DNA 羟甲基化测序(hMeDIP-seq)

技术简介 5hmC,作为 5- 甲基胞嘧啶(5mC)的氧化产物,是 DNA 甲基化修饰动态调控过程重要的中间产物。5hmC 主要富集在基因的转录起始位点,转录终止位点和基因远端区域的上游和下游。已有研究报道 5hmC 与癌症、神经退…
开放性染色质测序技术(ATAC-seq)

开放性染色质测序技术(ATAC-seq)

技术简介 在有限的细胞核空间中,基因组的大部分是紧密折叠的,仅留下需要转录的部分是开放的。活化的调控序列上结合有转录因子,转录因子会招募其他蛋白启动基因转录。人体内有些基因几乎一直处于开启状态,有些基因用过之后就被闲置在一边,它们的…
RNA 甲基化测序(MeRIP-seq)

RNA 甲基化测序(MeRIP-seq)

技术简介 m6A 是一种常见的 RNA 甲基化修饰方式,研究表明它在调控基因表达、剪接、RNA 编辑、RNA 稳定性、控制 mRNA 寿命和降解、介导环状 RNA 翻译等方面扮演重要角色。新开发微量 MeRIP-seq 技术,利用新…
单细胞甲基化测序(scWGBS)

单细胞甲基化测序(scWGBS)

技术简介 近年来,在肿瘤早筛和发育生物学研究领域,科学工作者对于 DNA 甲基化研究的关注度持续高涨。目前 DNA 甲基化的研究,大多数情况下依然是借助于亚硫酸氢盐修饰,而该过程会引起 DNA 的大量损失。所以需要对该过程加以优化以…
全基因组甲基化测序(WGBS)

全基因组甲基化测序(WGBS)

技术简介 全基因组甲基化测序(WGBS,Whole-genome bisulfite sequencing)结合了亚硫酸氢盐转化方法与新一代高通量测序技术,可在单碱基分辨率水平上高效地检测全基因组 DNA 甲基化状态。亚硫酸氢盐处理…
甲基化捕获测序(MC-seq)

甲基化捕获测序(MC-seq)

技术简介 SureSelectXT 甲基化靶向序列捕获平台(Methyl-Seq) 是安捷伦公司推出的全面的甲基化发现系统。该平台为甲基化基因组区域研究提供了具有单碱基分辨率的高度可靠且高效的方法。现有目录化产品包括人、小鼠和大鼠甲…
Illumina 甲基化芯片(850K)

Illumina 甲基化芯片(850K)

芯片简介 Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip 芯片(850K 芯片),为研究者提供了一个可靠且经济高效的甲基化分析平台。并为 FFPE 样本的检测改进了 protocol,以获得更可…
ChIP-Seq分析小实战(二)

ChIP-Seq分析小实战(二)

在ChIP-Seq分析小实战(一)中以将数据做好了准备,接着就是按照文章中所述将ChIP-seq数据用botwie比对至NCBIM37基因组上,但是这次我还是按照教程的方法,使用bowtie2比对至mm10基因组上 >The …