2021年12月 的所有文章

CIBERSORT R代码分析

CIBERSORT R代码分析

在R语言中运行Cibersort共需要三个文件,分别是(1)官方提供的22种细胞基因集“LM22.txt”;(2)自己的表达矩阵;(3)Cibersort代码。 (1)LM22.txt获取方法: 在Cibersort论文中(http…
R markdown 常用设置

R markdown 常用设置

1.knitr::opts_chunk$set() 全局设定,“()”内加入参数就可以对整篇报告进行设置 2.如果希望代码用R的大于号提示符开始, 用选项prompt=TRUE。 如果希望结果不用井号保护, 使用选项comment=…
R语言-Cox比例风险模型

R语言-Cox比例风险模型

Cox比例风险模型(cox proportional-hazards model),简称Cox模型 是由英国统计学家D.R.Cox(1972)年提出的一种半参数回归模型。该模型以生存结局和生存时间为应变量,可同时分析众多因素对生存期…
R中数据框之间的合并dplyr

R中数据框之间的合并dplyr

1、转换与合并left_join(a, b, by = “x1”): 向数据集a中加入匹配的数据集b记录(行)。right_join(a, b, by = “x1”): 向数据集b中加入匹配的数据集a记录。inner_join(a,…
R语言宽型与长型数据转换tidyr包

R语言宽型与长型数据转换tidyr包

前言 之前我们详细的学习了reshape2包,在数据处理阶段,它帮助我们很容易的实现长宽格式数据之间的转换。而今天所要学习的tidyr包可以看作是reshape2包的进化版本,该包的作者依旧是Rstudio的首席科学家,R语言界的大…