转录组学 的标签存档

转录组测序问题集锦

转录组测序问题集锦

转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合,转录组测序(RNA-seq) 是最近发展起来的利用深度测序技术进行转录分析的方法,可以对全转录组进行系统的研究。 Roche GS FLX Titanium 、Illumina…
Paired-End Tags (PET)用于转录组分析

Paired-End Tags (PET)用于转录组分析

3,236Transcriptomics PET概述将由各种前期实验得到较长的DNA片段,取出其前后两个端的小段序列,称作Paired-End Tags, 将这些tags进行测序然后map到基因组上,从这两个tags就可以知道得到了…
纵观转录组研究

纵观转录组研究

1 3,049Transcriptomics 如今人们进行转录组分析大多是在第二代测序平台上进行RNA-seq,将样品中的RNA反转录为cDNA,构建测序文库,再进行测序分析。随着RNA-seq技术的逐渐普及,自然也出现了许多RNA…
转录组数据饱和度评估方法

转录组数据饱和度评估方法

1 9,779Transcriptomics 基因表达分析里面,RNA-seq是现在转录组研究常用的技术了,但是通过二代测序获得数据后,在正式分析前我们通常需要做两件事情:其一是reads的饱和度分析,另一个是RNA-seq测序的数…
链特异性转录组原理

链特异性转录组原理

7,894Transcriptomics 实验原理:信息分析方法trinity有该分析比对流程,下面博主就不用多说了吧,分析方法基本一致,只不过拆开了再玩的节奏~~~不过比对的时候有个问题链方向性的问题,解决方案如下:链特异性转录组…
转录组cummeRbund操作笔记

转录组cummeRbund操作笔记

1,876Transcriptomics 这是跟tophat和cufflinks套装紧密搭配使用的一个R包,能出大部分文章要求的标准化图片。一:安装并加装该R包安装就用source(“http://bioconductor.org/…